El programa de Doctorado está diseñado para una duración de 8 semestres.
El plan de estudios del Programa consta de actividades lectivas durante el primer año. En el caso de las actividades lectivas se deberá cursar la asignatura obligatoria Biología Celular y Molecular Avanzada (Código BIOQ400) durante el primer semestre y asignaturas electivas de acuerdo a los intereses del alumno durante el segundo semestre. El examen de calificación basado en la defensa del Proyecto de Tesis se rinde durante el tercer semestre y la tesis doctoral se ejecuta por el resto del programa. Todos los Planes de Estudios deberán incluir al menos 15 créditos en asignaturas obligatorias y electivas. Además, los planes de estudio deben incorporar al menos un Seminario bibliográfico y una Unidad de Investigación la cual podrá realizarse en la UACh u otras Universidades o Centros de Investigación nacional o internacional previo a rendir el examen de calificación. Para inscribir Tesis, es prerrequisito tener aprobado el Examen de Idioma y el Examen de Calificación.