El programa de Magíster en Paleontología tiene por misión otorgar las bases teóricas, experimentales y metodológicas para proyectar y desarrollar actividades de investigación, así como promover la gestión del patrimonio paleontológico, entender y discutir el marco legal que regula esta disciplina.

Su sello se centra en la entrega y generación de conocimientos sobre la evolución e interacciones de los organismos en la historia de la Tierra, en un contexto paleoambiental.